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龙图腾网获悉华东理工大学;上海交通大学申请的专利一种动态酶约束基因组规模代谢网络模型构建方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119418751B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-14发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202411276175.5，技术领域涉及：G16B5/00；该发明授权一种动态酶约束基因组规模代谢网络模型构建方法是由颜学峰;鲁洪中;曹凌峰;范星存;廖文彬设计研发完成，并于2024-09-12向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种动态酶约束基因组规模代谢网络模型构建方法在说明书摘要公布了：本发明公开了一种动态酶约束基因组规模代谢网络模型构建方法，包括以下步骤：步骤S1，确定动力学模型，得到反应通量以及代谢物随时间变化的具体数值；步骤S2，根据不同反应通量对ecGEMs中相同反应进行上下界约束，通过FBA求解得到生物体全部反应随时间变化的通量变化情况；步骤S3，对模型进行验证。采用可以将ecGEMs动态化，解决了ecGEMs不能获得代谢物浓度以及胞内反应通量随时间变化的问题。并且大幅度提升ecGEMs模型精确度，对研究系统生物学和合成生物学研究具有重要意义。

本发明授权一种动态酶约束基因组规模代谢网络模型构建方法在权利要求书中公布了：1.一种动态酶约束基因组规模代谢网络模型构建方法，其特征在于，包括以下步骤： 步骤S1，确定动力学模型，得到反应通量以及代谢物随时间变化的具体数值； 步骤S1中收集已有完善ecGEMs的生物体，包括大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌、谷氨酸棒状杆菌、溶脂亚罗菌、黑曲霉，动力学模型涉及对生物体代谢有重要影响的途径，包括糖酵解途径，三羧酸循环，磷酸戊糖途径，脂质合成； 步骤S1中通过运行生物体动力学模型得到ecGEMs的输入约束，公式表示如下： ， 其中是第个途径的动力学模型计算获得反应通量，是第个动力学模型输入变量，t是时间变量，为已经构建好的动力学模型数量； 步骤S2，根据不同反应通量对ecGEMs中相同反应进行上下界约束，通过FBA求解得到生物体全部反应随时间变化的通量变化情况；步骤S2中，根据得到的不同稀释速率下动力学模型中的反应通量作为参考值，将其乘以，，作为ecGEMs中相同反应的通量下限，乘以，，作为ecGEMs中相同反应的通量上限，运行FBA得到酿酒酵母所有反应通量随时间变化的分布情况； 所述FBA公式表示如下： ， 其中，是反应矩阵，为反应通量，是目标向量，为在动态模型中涉及到的反应，为当前时刻动力学模型得到的反应通量值，为第j个反应的反应下界，为第j个反应的反应上界，为剩余反应通量值，为酶浓度，为酶的动力学参数酶周转数； 步骤S3，对模型进行验证，模型验证包括三种方法：通量变异性分析，模型自验证，实验数据验证； 所述通量变异性分析方法公式表示如下： ， 其中是以下公式的最优解： ， 是一个取值为0到1的参数，是反应矩阵，m代表代谢物数量，n代表反应数量，为反应通量，为第j个反应的反应下界，为第j个反应的反应上界，是目标向量，为剩余反应通量值，为酶浓度，为酶的动力学参数酶周转数； 所述模型自验证是以生物体的实际通量实验数据为参考，对动力学模型与生物体ecGEMs共同的n个反应进行灵敏度分析，挑选出其中灵敏度最大与最小的m个反应共2m条反应，比较动态EMP模型得到的剩余的n-2m条反应与ecGEMs固定选出的2m条反应运行FBA得到剩余的n-2m条反应作对比进行模型的自验证。

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