浙江天科高新技术发展有限公司王美霞获国家专利权
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龙图腾网获悉浙江天科高新技术发展有限公司申请的专利基于Sanger测序ab1文件半双峰情况的识别纠正方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119626332B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-14发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411692671.9,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权基于Sanger测序ab1文件半双峰情况的识别纠正方法是由王美霞;栾雨濛;车阳;洪烨;钟啸萍;高雯雯;张力;王庭璋设计研发完成,并于2024-11-25向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于Sanger测序ab1文件半双峰情况的识别纠正方法在说明书摘要公布了:本发明提供了一种基于Sanger测序ab1文件半双峰情况的识别纠正方法,本发明可以通过对ab1文件进行第一峰和第二峰的序列及相关峰高信息读取,并通过对第一峰和第二峰的比对筛选出可能存在半双峰情况的文件,然后对相应碱基及峰高进行纠正,最终得到纠正后的scf文件和fasta文件用于后期序列分析。本发明提供了一种有效的解决Sanger测序中ab1文件半双峰现象的方法,提高了测序数据的准确性和可靠性,避免了反复重测带来的测序成本、分析成本和时间成本。
本发明授权基于Sanger测序ab1文件半双峰情况的识别纠正方法在权利要求书中公布了:1.一种基于Sanger测序ab1文件半双峰情况的识别纠正方法,其特征在于,包括: 1读取ab1文件得到碱基及对应峰高信息,然后得到每个峰顶峰底位置,从而得到第一峰和第二峰的序列文件; 2对第一峰和第二峰的序列进行比对分析,输出比对结果文件,并判断文件是否存在半双峰情况; 3针对存在半双峰情况的序列,从半双峰起始位置到结束位置对原始序列进行碱基纠正及峰高纠正; 4将完成纠正后的所有相关信息写入新的scf文件和fasta文件; 步骤1中,在得到的峰顶位置,若第二峰的高度不足以达到认定为是一个明确的峰,即第二峰的峰高小于第一峰峰高的10%,则使用第一峰碱基序列代替第二峰的相应位置; 步骤2中,基于Needleman-WunschNW算法对第一峰和第二峰进行序列比对,罚分规则为: Match=1 Mismatch=-1 Gap=-10 所述比对结果文件采用六行结构输出,第一行为ab1文件名称,第二行为序列比对identify,第三行为gap数,第四行为第一峰序列,包含引入的GAP;第五行为对比结果,其中“|”表示碱基匹配,“.”表示碱基不匹配,“”表示引入GAP;第六行为第二峰序列,包含引入的GAP; 步骤2中,存在半双峰情况判断需满足以下条件: 2.1比对存在gap; 2.2序列一致度identify90%或出现gap的区间中序列一致度identify93%。
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