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龙图腾网获悉中国医学科学院基础医学研究所申请的专利具有时空特异性的药物靶点的筛选方法、系统和计算机设备获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN121306248B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-14发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202511830157.1，技术领域涉及：G16B20/30；该发明授权具有时空特异性的药物靶点的筛选方法、系统和计算机设备是由陈阳;高媛;李雪媛设计研发完成，并于2025-12-05向国家知识产权局提交的专利申请。

本具有时空特异性的药物靶点的筛选方法、系统和计算机设备在说明书摘要公布了：本发明公开一种具有时空特异性的药物靶点的筛选方法、系统和计算机设备，涉及生物信息学和计算生物学技术领域。所述筛选方法基于单细胞转录组测序数据，所述方法包括：1定量重构细胞在组织中的空间定位和功能模式，其包括：1.1将所述单细胞转录组测序数据进行数据预处理；1.2对单细胞空间定位的重构；1.3对单细胞生物学功能模式的重构；2筛选具有时空特异性的药物靶点，其包括：2.1细胞‑细胞通讯分析；2.2构建以特定组织微环境状态为核心的基因调控网络GRN；2.3靶点发现。本发明验证了一种具有创新性的单细胞数据分析方法，也为代谢性疾病和其他系统性疾病的药物研发提供了新的思路与技术路径，具备推广与应用的基础。

本发明授权具有时空特异性的药物靶点的筛选方法、系统和计算机设备在权利要求书中公布了：1.一种具有时空特异性的药物靶点的筛选方法，其特征在于，所述筛选方法基于单细胞转录组测序数据，所述方法包括： 1定量重构细胞在组织中的空间定位和功能模式，其包括： 1.1将所述单细胞转录组测序数据进行数据预处理，所述数据预处理包括以下步骤： 1.1.1数据质控与整合：对所述单细胞转录组测序数据进行质量控制和归一化，去除低质量的细胞和低表达基因，并进行数据整合、主成分分析降维和Louvain无监督聚类； 1.1.2细胞类型注释：使用统一流形逼近投影算法，对聚类结果进行非线性降维，以及进行细胞类型注释； 1.2对单细胞空间定位的重构，其包括以下步骤： 1.2.1空间定位基因集构建：根据空间组学数据，将研究的组织划分为多个分区，分别构建各个区域出现最高表达的基因集； 1.2.2非负矩阵分解：将步骤1.1得到的细胞总群体基因表达矩阵使用非负矩阵分解NMFbrunet算法，分解为每个空间分区对应的marker基因集表达矩阵与细胞在不同空间分区上的分布得分矩阵之积； 1.2.3对NMF抽提出的矩阵进行UMAP降维与可视化，重构各细胞亚群空间定位； 1.3对单细胞生物学功能模式的重构，其包括以下步骤： 1.3.1单样本基因集富集分析ssGSEA：针对指定的功能模块中各条通路，基于步骤1.1得到的细胞总群体基因表达矩阵进行ssGSEA富集打分； 1.3.2对ssGSEA得分矩阵进行UMAP非线性降维、K最近邻图谱构建与Leiden无监督聚类； 1.3.3输出每个单细胞的特定功能特征分类结果，以及每类功能模式在各通路上的富集得分情况； 2筛选具有时空特异性的药物靶点，其包括以下步骤： 2.1进行细胞-细胞通讯分析，其包括：分析步骤1.1注释出的各细胞亚群与其他细胞类型之间的通讯概率及配体-受体互作对，联合步骤1.2和步骤1.3对每个细胞重构出的空间分区和功能模式建立空间功能特征与细胞互作网络之间的映射关系； 2.2构建以特定组织微环境状态为核心的基因调控网络GRN，其包括：计算细胞亚群间的互作记录，以及对hub基因进行基因调控网络分析； 2.3靶点发现，其包括：从所述基因调控网络GRN中筛选关键调控因子与信号节点，所得的hub基因及其连接的核心节点即为潜在的具有时空特异性的药物靶点。

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