国科大杭州高等研究院刘小平获国家专利权
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龙图腾网获悉国科大杭州高等研究院申请的专利基因调控网络的推断方法、装置、设备及存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN121565251B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202610077361.9,技术领域涉及:G16B25/10;该发明授权基因调控网络的推断方法、装置、设备及存储介质是由刘小平;谢宇珂;常啸设计研发完成,并于2026-01-21向国家知识产权局提交的专利申请。
本基因调控网络的推断方法、装置、设备及存储介质在说明书摘要公布了:本申请公开了一种基因调控网络的推断方法、装置、设备及存储介质,涉及生物信息学技术领域,通过双边自表征模型提供的矩阵分解框架求解细胞间调控关系矩阵,能够为细胞间调控提供更准确的因果关系推断。其中方法包括:获取第一基因表达矩阵和第二基因表达矩阵;以第一基因表达矩阵作为输入,采用不同基因调控推断算法进行调控关系预测,构建全局基因调控邻接矩阵;将全局基因调控邻接矩阵与第二基因表达矩阵嵌入至双边自表征模型,以通过双边自表征模型进行第一次求解计算,得到细胞间调控关系矩阵;在设定细胞类型的基础上,根据第二基因表达矩阵与细胞间调控关系矩阵进行第二次求解计算,得到设定细胞类型的基因调控网络。
本发明授权基因调控网络的推断方法、装置、设备及存储介质在权利要求书中公布了:1.一种基因调控网络的推断方法,其特征在于,包括: 获取第一基因表达矩阵和第二基因表达矩阵,所述第一基因表达矩阵为源自相同组织的批量RNA测序数据的基因表达矩阵,所述第二基因表达矩阵为源自相同组织的单细胞RNA测序数据的基因表达矩阵; 以所述第一基因表达矩阵作为输入,采用不同基因调控推断算法进行调控关系预测,构建全局基因调控邻接矩阵; 将所述全局基因调控邻接矩阵与所述第二基因表达矩阵嵌入至双边自表征模型,以通过所述双边自表征模型进行第一次求解计算,得到细胞间调控关系矩阵; 在设定细胞类型的基础上,将所述第二基因表达矩阵对应的子矩阵与所述细胞间调控关系矩阵对应的子矩阵嵌入至双边自表征模型,以通过所述双边自表征模型进行第二次求解计算,得到设定细胞类型的基因调控网络; 其中,所述双边自表征模型使用如下公式: 其中,为第二基因表达矩阵,为全局基因调控邻接矩阵,为待求解的细胞间调控关系矩阵; 在第二次求解计算过程中,通过双边自表征模型输出编码单细胞表达异质性与细胞间调控关联约束的第二融合表征矩阵;对第二融合表征矩阵进行伪逆求解,得到设定细胞类型的基因调控网络; 所述对第二融合表征矩阵进行伪逆求解,使用如下公式: 其中,为设定细胞类型的基因调控网络,为设定细胞类型的基因表达子矩阵,为设定细胞类型的细胞间调控关系子矩阵。
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