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浙江理工大学李金恒获国家专利权

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龙图腾网获悉浙江理工大学申请的专利一种基于图像的DNA甲基化位点识别方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117037904B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-05-01发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310937711.0,技术领域涉及:G16B20/30;该发明授权一种基于图像的DNA甲基化位点识别方法是由李金恒;蔡晟博;曾贞鹏;代琦设计研发完成,并于2023-07-28向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于图像的DNA甲基化位点识别方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于图像的DNA甲基化位点识别方法。本发明包括以下步骤:首先,利用不同大小的识别窗口对原始Nanopore测序数据集进行电流信号预处理,获得预处理后的测序数据集;接着,利用格拉姆角场方法对预处理后的测序数据集进行数据转换,获得二维图像数据集;再对深度神经网络模型进行训练后,获得DNA甲基化位点识别模型以及对应的识别精度;然后根据识别精度确定最佳识别窗口和DNA甲基化位点识别模型,从而实现对待识别的Nanopore测序数据进行识别。本发明将一维的电流数据向二维的图像数据进行转化,进而借助计算机图像识别的能力对图像进行识别处理,因此能够准确识别出是否发生甲基化或者发生的甲基化类型。

本发明授权一种基于图像的DNA甲基化位点识别方法在权利要求书中公布了:1.一种基于图像的DNA甲基化位点识别方法,其特征在于,包括以下步骤: S1:设置识别窗口的大小初值; S2:基于当前识别窗口对原始Nanopore测序数据集进行电流信号预处理,获得预处理后的Nanopore测序数据集; S3:利用格拉姆角场方法对当前预处理后的Nanopore测序数据集进行数据转换后,获得当前二维图像数据集; 所述S3具体为: S31:对预处理后的Nanopore测序数据集进行数据缩放,获得缩放后的Nanopore测序数据集; S32:对缩放后的Nanopore测序数据集进行坐标转换,获得极坐标系下的测序数据点集; S33:计算极坐标下的测序数据点集的格拉姆角场,获得准格拉姆矩阵集; S34:基于准格拉姆矩阵集,确定格拉姆角场的值的密度分布后生成二维图像,进而获得二维图像数据集; S4:根据当前二维图像数据集,对深度神经网络模型进行训练后,获得DNA甲基化位点识别模型以及对应的识别精度;所述深度神经网络模型包括相连的卷积神经网络和ViT模型; S5:不断改变识别窗口的大小,重复S2-S4,获得不同识别窗口对应的DNA甲基化位点识别模型以及识别精度,将最佳的识别精度对应的识别窗口和DNA甲基化位点识别模型记为最佳识别窗口和DNA甲基化位点识别模型; S6:利用最佳识别窗口对待识别的Nanopore测序数据进行处理后再输入到DNA甲基化位点识别模型中,获得DNA甲基化位点的识别结果。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人浙江理工大学,其通讯地址为:310018 浙江省杭州市江干区下沙高教园区2号大街928号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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