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一种灵芝孢子粉细胞外囊泡实验结果分析方法及系统
本发明公开了一种灵芝孢子粉细胞外囊泡实验结果分析方法及系统,涉及数据分析的技术领域。通过引入趋势一致性分析与样本依赖特征识别机制,构建了面向高维组学数据和动物实验结果的趋势稳定性评估流程,不仅能够识别由极端样本、批次效应或仪器偏移引发的伪趋...
一种泛癌脑转移瘤的药物敏感性预测系统、方法和介质
本发明涉及生物信息技术领域,具体涉及一种泛癌脑转移瘤的药物敏感性预测系统、方法和介质。本发明的泛癌脑转移瘤的药物敏感性预测系统通过构建脑转移瘤样本的关键调控因子集合,预测脑转移样本对药物的敏感性。本发明的泛癌脑转移瘤的药物敏感性预测系统能够...
一种基于空间转录组的组织结构混乱程度评价方法、系统、设备及介质
本发明涉及生物医学技术领域,公开一种基于空间转录组的组织结构混乱程度评价方法、系统、设备及介质,包括:获取目标群体相同部位生物学样本的空间转录组测序数据;整合空间转录组测序数据,得到基因表达矩阵和坐标信息,进行位点类型鉴定,通过改进型简单线...
一种基于GCA和Shiny框架的作物杂交种预测平台系统
本发明公开了一种基于GCA和Shiny框架的作物杂交种预测平台系统,包括前端界面层、业务逻辑层、数据管理层和算法引擎层,本发明涉及农业信息技术和生物信息学技术领域。该基于GCA和Shiny框架的作物杂交种预测平台系统,工作效率显著提高,一站...
基于自蒸馏对比学习的蛋白质点突变效应零样本预测系统
本发明公开了一种基于自蒸馏对比学习的蛋白质点突变效应零样本预测系统,包括:数据导入模块、深度神经网络模型加载模块和突变效应预测模块。所述深度神经网络模型加载模块加载的深度神经网络模型由包含WDB模块和改进的Transformer模块的特征处...
蛋白质热稳定预测方法、预测模型训练装置及相关设备
本申请实施提供一种蛋白质热稳定预测方法、预测模型训练装置及相关设备。该方法包括获取初始待测序列及对应的突变待测序列;基于蛋白质预训练模型对初始待测序列和突变待测序列进行特征提取,得到初始待测序列对应的初始待测特征,以及突变待测序列对应的突变...
新生抗原分析
癌症免疫学为癌症治疗提供了有希望的新途径,但是验证待针对为靶标的潜在的新生抗原是成本高的且昂贵的。分析MHC结合亲和力、抗原加工、与已知抗原的相似性、预测的表达水平(作为mRNA或蛋白质)、自相似性和突变体等位基因频率,提供了使用测序数据鉴...
一种基于多维统计指数的空间转录组组织特异表达基因识别方法及其系统
本申请提供了一种基于多维统计指数的空间转录组组织特异表达基因识别方法及其系统,属于基因识别技术领域,该方法包括:获取多个基因分别在不同细胞中对应的基因表达数据,不同细胞属于不同类型的组织;基因表达数据为基于空间转录组处理后的数据;针对每一基...
一种高效筛选水稻耐碱基因的方法
一种高效筛选水稻耐碱基因的方法,涉及基因工程技术领域。本发明方法包括:对耐碱和碱敏感两个水稻品种进行幼苗培养和碱胁迫处理,找到两个水稻品种表型明显差异;在碱性胁迫后不同时间点进行水稻组织取样,对获取的水稻组织样品进行生长指标、生理生化指标、...
一种基于深度学习的RNA远同源检测方法及系统
本发明公开了一种基于深度学习的RNA远同源检测方法及系统,属于生物信息学领域,通过将RNA序列数据集划分为多个集合后构建包含远同源对的多个训练数据集,从而分别基于各个训练数据集对RNA远同源检测模型进行训练,得到多个模型变体,并基于独立测试...
一种HER2变异肺癌患者免疫细胞变化的分析方法和系统
本发明公开了一种HER2变异肺癌患者免疫细胞变化的分析方法和系统,该方法包括:采集外周血样本并进行单细胞RNA测序;对测序数据进行质量控制、标准化处理、降维和聚类分析;基于预设免疫细胞标志物对聚类结果进行免疫细胞亚群注释;利用配体-受体数据...
核酸适配体生成与筛选方法、装置、电子设备及程序产品
本申请适用于深度学习技术领域,提供了一种核酸适配体生成与筛选方法、装置、电子设备及程序产品。所述方法包括:将目标蛋白质输入蛋白质结构编码器,提取目标蛋白质的第一蛋白质特征;将引导条件和引导强度系数输入条件扩散模型,生成至少一个候选核酸适配体...
基于多组学数据的蜂王育种值评估与核心种群遴选方法
本发明公开基于多组学数据的蜂王育种值评估与核心种群遴选方法,涉及蜜蜂遗传育种与多组学数据应用技术领域,步骤为:获取候选蜂王基因组、肠道微生物组及宿主转录组数据;分析数据筛选抗病相关核心微生物标志物、免疫基因及菌‑基因互作网络特征;以这些特征...
一种基于空间转录组的衰老敏感位点鉴定方法、系统、设备及介质
本发明涉及生物医学技术领域,公开一种基于空间转录组的衰老敏感位点的鉴定方法、系统、设备及介质,包括:根据待鉴定目标的器官组织的空间转录组测序数据集,得到待鉴定目标的器官组织中不同类型位点的衰老差异基因数据;将待鉴定目标的器官组织中不同类型位...
一种基于多模态数据与大模型的林木智能育种方法
本申请提供一种基于多模态数据与大模型的林木智能育种方法,涉及林木遗传育种技术领域。该方法包括:获取并整合目标树种的基因型数据、表型数据、多组学数据及环境时序数据,进行预处理与特征融合,形成用于分析的多模态数据集;基于多模态数据集,采用基因型...
计算机模拟预测和筛选结核分枝杆菌表位mRNA疫苗及其应用
本发明公开了一种计算机模拟预测和筛选结核分枝杆菌表位mRNA疫苗,制备包括如下步骤,细菌蛋白序列获取与信号肽分析步骤,通过数据库获取蛋白质ESAT6,CFP10,Ag85A,Ag85B,TB10.4,PPE68,PPE18,Rv1813c的...
一种基于知识图谱的SLC蛋白—疾病关联预测方法
本发明公开了一种基于知识图谱的SLC蛋白—疾病关联预测方法,其步骤包括:1)基于SLC蛋白与疾病的相关数据构建SLC蛋白‑疾病的知识图谱;2)利用卷积神经网络模型对知识图谱进行分析和挖掘,获取SLC蛋白与疾病在不同生物通路所存在的潜在关联,...
基于数据挖掘的谷子基因筛选方法、系统及存储介质
本申请涉及生物信息学与分布式计算技术领域,公开了一种基于数据挖掘的谷子基因筛选方法、系统及存储介质,方法包括:获取谷子基因数据进行初始聚类处理,划分为多个数据区段得到区段集合;评估区段集合中每个数据区段的资源需求指标;获取计算节点的当前负载...
一种模型假设无关的生存分析标志物发现方法及装置
本发明提出一种模型假设无关的生存分析标志物发现方法及装置,所述方法包括:采集多个病人随访生存数据,建立生存数据集,该数据集的样本包括:反映病人预后情况的生物标志物的多维特征、实际观测时间和是否观测到感兴趣事件发生的标签;构建无模型生存分析标...
一种用于挪威云杉的基因型填充优化方法及参考面板
本发明公开了一种用于挪威云杉的基因型填充优化方法及参考面板,属于林木遗传技术领域。该方法包括:构建基于大规模挪威云杉重测序数据的单倍型参考面板;获取低密度基因型数据;使用IMPUTE5软件并整合挪威云杉遗传图谱进行基因型填充;对填充结果进行...
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