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多源数据协同梨精准育种规划的大模型构建方法及系统
本发明属于育种规划技术领域,具体涉及多源数据协同梨精准育种规划的大模型构建方法及系统,该方法通过获取多源协同数据集并构建五维关联矩阵,建立多维度数据的统一关联基础;基于此构建约束型知识表达结构并训练约束一致性推理模型,以约束驱动方式解析用户...
融合序列与结构信息的血脑屏障穿透肽预测方法及系统
本发明涉及一种融合序列与结构信息的血脑屏障穿透肽预测方法及系统。所述方法包括:获取待预测的肽的氨基酸序列分别输入预训练的ESM‑2蛋白质语言模型、ESMFold模型,得到序列模态特征、结构模态特征;通过双向跨模态协同注意力机制进行双向特征对...
一种大肠杆菌培养自动控制方法和系统
本发明实施例提供一种大肠杆菌培养自动控制方法和系统,属于大肠杆菌培养技术领域。所述自动控制方法包括:构建用于识别DO基线的ANN模型;基于DO‑stat策略运行过程中DO基线的数值变化规律,构建数据生成算法,以用于生成训练样本;将所述训练样...
一种微生物培养实验数据云处理系统
本发明公开了一种微生物培养实验数据云处理系统,涉及微生物培养数据处理技术领域,包括:实验数据采集模块,生成标准化微生物培养数据集;生长规律挖掘模块,进行时序趋势分析与核心特征提取,划分微生物生长阶段并提取各阶段关键参数,生成微生物生长规律特...
基于网络毒理学、机器学习与实验验证的银杏种子毒性机制解析方法
本发明提供了基于网络毒理学、机器学习与实验验证的银杏种子毒性机制解析方法,该银杏种子毒性机制解析方法包括银杏种子毒性成分相关靶点与胃肠道毒性相关靶点的筛选及交集分析,胃肠道毒性相关差异表达基因(DEGs)筛选与加权基因共表达网络分析(WGC...
一种基于癌症特异的染色质可及性标志物的组织起源推断方法及装置
本发明公开了一种基于癌症特异的染色质可及性标志物的组织起源推断方法、装置及存储介质,属于基因检测技术领域。该方法旨在解决利用低成本浅层全基因组测序数据进行精准癌症溯源的难题。本发明提出一种片段离散性指数,该指数结合游离DNA片段的末端分散度...
氨基酸序列生成模型训练方法及抗体生成方法
本说明书实施例提供氨基酸序列生成模型训练方法及抗体生成方法,其中所述氨基酸序列生成模型训练方法包括:获取针对目标项目的氨基酸序列样本数据集合,并根据所述氨基酸序列样本数据集合获得针对目标项目的项目蛋白打分模型;根据预设氨基酸序列生成模型生成...
一种差向异构酶基因的快速挖掘方法
本发明涉及生物工程和基因工程领域,特别提供了一种异构酶基因的快速挖掘方法。该方法基于大数据分析和生物信息学技术,结合序列比对、基因表达分析和功能预测等手段,实现了异构酶基因的快速、准确挖掘,为酶工程领域的发展和应用提供了有力的技术支持。
用于提高单细胞扩增基因组覆盖度的基因文库获取方法
本发明涉及生物信息领域,公开了用于提高单细胞扩增基因组覆盖度的基因文库获取方法。针对单细胞扩增基因组覆盖度不足的问题,所述基因文库获取方法提供复合文库构建与优化数据整合的策略,包括:针对同一单细胞样品,构建平均片段长度不同的至少一个原文库和...
一种可学习图的域适应单细胞分类方法
本发明公开了一种可学习图的域适应单细胞分类方法,采用公共单细胞转录组数据库;采用“留一法”将原始数据集划分为参考数据集(有细胞类型标签)和查询数据集(无细胞类型标签);构建可学习图的域适应单细胞分类网络;构建统一联合损失函数;将划分的参考数...
一种基于大数据的甘蔗亲本检测及定位系统
本发明公开了一种基于大数据的甘蔗亲本检测及定位系统,涉及农业生物技术领域,该系统包括以下组成部分:数据采集模块:采用时空动态采样策略采集叶片样本测序,并按生长特性调整传感器网络采样频率,采集甘蔗亲本苗期、分蘖期、成熟期的基因表达变化数据、田...
一种基于单细胞转录组测序检测病毒载量的方法
本发明涉及单细胞转录组学和微生物组学技术领域,具体为一种基于单细胞转录组测序检测病毒载量的方法,步骤为:提取单细胞转录组测序数据形成单细胞基因表达矩阵,与宿主比对文件比对提取读数数据;将读数数据经动态翻译,生成氨基酸序列;将氨基酸序列与病毒...
一种基于知识图谱的金华猪育种性状预测方法及系统
本发明提供了一种基于知识图谱的金华猪育种性状预测方法及系统,涉及动物育种技术领域,包括首先获取涵盖基因组、生长、系谱、胴体、环境及三维形态的多源数据,并构建为融合实体与关联的初始知识图谱。进而,在图谱中搜索从祖代基因经特定温度环境至后代性状...
一种高通量鉴定天然功能性短肽的方法
本发明属于海洋生物技术与生物信息学交叉领域,具体涉及一种高通量鉴定天然功能性短肽的方法。当前,非模式物种中穿透肽,抗菌肽等多类功能性短肽的开发和应用仍存在瓶颈,其主要因为物种间的差异(氨基酸偏好性,受体特异性)限制了已有的功能性短肽在复杂多...
耐药性关键基因筛选方法、装置、电子设备及存储介质
本发明涉及基因筛选技术领域,具体涉及一种耐药性关键基因筛选方法、装置、电子设备及存储介质,包括以下步骤:利用第一神经网络构建出用于在mRNA表达谱中得到耐药性基因表达谱的耐药性基因提取任务,利用第二神经网络构建出用于在耐药性基因表达谱得到耐...
一种基于肿瘤免疫微环境和肿瘤突变负荷的新型肿瘤免疫分型模型及其应用
本发明提供了一种基于肿瘤免疫微环境和肿瘤突变负荷的新型肿瘤免疫分型模型及其构建方法,属于生物技术领域。本发明基于IMvigor210和内部免疫治疗队列的RNA‑seq数据和IHC验证数据,筛选得到7个基因标记物,并运用Lasso‑logis...
基于图对比学习的空间转录组细胞组成推断方法
本发明提供基于图对比学习的空间转录组细胞组成推断方法,该方法构建跨模态低维特征空间数据模拟模块,将单细胞与空间转录组数据分别映射至潜在嵌入空间,对齐分布减小特征空间差异,增强跨模态数据的结构一致性;设计双异构图构建与潜在关系学习模块,基于基...
基于低深度测序的一体化基因组分析方法
本发明涉及生物医药领域,公开了基于低深度测序的一体化基因组分析方法,该方法包括:获取全基因组低深度测序数据;经质控、比对后计算SNV、Indel及CNV;结合基因组位置、编码影响、剪接扰动、保守性、调控元件及三维染色质互作进行多维功能注释;...
一种基于动力学模型结合人工智能算法的蛋白磷酸化位点功能评价方法
本发明涉及生物信息领域,公开基于动力学模型结合人工智能算法的蛋白磷酸化位点功能评价方法。包括S1获取细胞在N种条件下的胞内组学数据;S2将每种条件下的组学数据逐一作为参照,同时将S1的数据代入到动力学模型中,通过引入贝叶斯算法估计模型参数;...
一种基于组装的全基因组结构变异识别方法和装置
本发明涉及一种基于组装的全基因组结构变异识别方法和装置,方法包括:获取查询基因组,对查询基因组与参考基因组进行比对,获取比对文件;对比对文件进行预处理;根据预处理后的比对文件,进行比对记录的分块与聚类分析,得到聚类结果;对各个聚类内部以及不...
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