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  • 本发明涉及模型构建技术领域,公开了一种多模态空间组学数据分析模型构建方法及整合分析方法,构建方法包括:确定目标样本对应的多模态空间组学数据集;将不同模态类型的空间组学数据分别输入对应的特征提取模型,获得每个模态类型的初始特征数据;将初始特征...
  • 本发明属于生物人工智能技术领域,公开了一种基于人工智能的噬菌体库筛选与管理方法及应用。包括数据采集、特征建模、AI模型训练、评分与推荐、反馈更新。本发明显著提高噬菌体筛选速度与准确性,避免单纯依赖试错式实验,节省成本,并且提供动态更新的库管...
  • 本发明提供一种基于群智能算法在基因表达谱的双聚类方法,属于基因表达技术领域,方法包括如下步骤:对基因表达数据矩阵进行构造索引矩阵,获取双聚类种子,初始化种群,以双聚类种子为第一种群个体,然后将第一种群个体加入到第二种群中进行种群扩大,得到两...
  • 本发明公开了一种基于排序模型的PBAE聚合物筛选方法,该方法包括:构建数据集,基于多源PBAE聚合物实验数据,按文献与实验单位分组,从数据充足的组中选取最优样本作为验证集,其余作为训练集;特征提取,根据聚合物的分子结构信息自动组装聚合物结构...
  • 本发明涉及基于高通量测序子宫内膜癌分子分型的文库构建方法,涉及医疗数据处理技术领域,本发明通过建立了临床指标‑分子特征联的动分型体系,整合外周血LDL浓度等临床代谢指标与肿瘤组织通路基因的测序数据,建立多维度数据分析模型,实现子宫内膜癌的代...
  • 本申请涉及一种用于确定同源基因家族中目标成员基因拷贝数的方法、计算设备及程序产品。该方法包括:确定参考基因组的多个分析区间;基于待测样本及参考样本的测序数据与所述参考基因组的保留多重比对序列的比对结果,确定所述待测样本及所述参考样本在各分析...
  • 本申请提供了用于基因序列比对的方法及电子设备,其中比对过程分为种子查找阶段和种子扩展阶段,在种子查找阶段为待比对的读段序列确定多个种子,在种子扩展阶段基于这些种子获取待进行比对的多个查询序列及其相应参考序列;将各序列的长度扩展SIMD指令的...
  • 本申请涉及分子免疫学与生物技术领域,尤其是涉及一种干燥综合征模型小鼠B细胞免疫组库测序与亚群分析方法。该方法包括:S1、样本制备:从目标自身免疫性疾病动物模型以及对照动物的预设组织中,制备单细胞悬液并对单细胞悬液进行B细胞富集处理,获得B细...
  • 本申请公开一种序列比对方法及其种子搜索方法及设备。其中种子搜索方法包括:基于参考基因组序列S构建索引结构,其中,所构建的索引结构包括FM‑Index索引以及TBWT数组、TOCC数组、CNT数组。从待比对的碱基片段中取出最后一个碱基作为初始...
  • 本申请公开用于加速基因比对执行过程的系统及方法。该系统包括处理线程管理模块、一个或多个动态缓存和动态缓存管理模块。其中,处理线程管理模块被配置为将基因比对流程设置为多级流水线,基因比对流程的每个执行步骤对应所述多级流水线上的一个流水级,并为...
  • 本申请实施例提供了一种遗传病变异筛选方法和相关设备,属于信息处理技术领域。该方法包括:获取受检者的临床表型信息;通过第一自然语言处理模型对临床表型信息进行中文特征向量化,得到中文向量化信息,以及通过第二自然语言处理模型对临床表型信息进行英文...
  • 本发明提出了一种快速检测微生物物种的方法,具体地,所述方法包括构建双水平数据库及对应的基因簇;基于所述数据库和所述基因簇构建参考矩阵X;将待测的二代测序数据与所述基因簇进行比对,以生成等价类,基于所述等价类和所述基因簇构建计数矩阵Y;基于所...
  • 本发明提出了一种快速检测微生物物种的方法,具体地,所述方法包括构建双水平数据库及对应的基因簇;基于所述数据库和所述基因簇构建参考矩阵X;将待测的三代测序数据与所述基因簇进行比对,以生成等价类,基于所述等价类和所述基因簇构建计数矩阵Y;基于所...
  • 本发明涉及一种基于功能注释丰度序列的基座模型训练方法及装置。所述方法包括:S1,对基因组或宏基因组样本的开放阅读框进行功能注释;S2,统计各注释出现次数并按丰度降序构建序列;S3,将所述序列进行 token 化后输入基于 Transform...
  • 本公开提供了一种评估基因组脱靶的方法,包括使用表观编辑工具对靶向位点进行甲基化和组蛋白修饰,并对所述修饰后的基因进行全基因组转录组测序、全基因组甲基化测序和CUT&Tag测序,其中CUT&Tag测序包含H3K4me3、H3K9ac、H3K2...
  • 本发明的目的在于提供一种基因序列信息比对和校正方法、装置,包括:输入待三代测序的数据;利用分半对比策略,对数据进行粗对比,得到粗对比后的数据;对粗对比后的数据进行解析,得到解析后的数据;并构建比对数据库;通过解析后的数据与比对数据库进行BL...
  • 本发明公开了一种基于深度学习的抗菌肽识别与多属性预测方法,涉及生物信息技术领域,包括以下步骤:获取原始氨基酸序列和活性标签,对所述原始氨基酸序列进行标准化预处理,生成标准化短肽序列;对所述标准化短肽序列进行三维构象预测和编码处理,并通过五视...
  • 本发明公开一种河流沉积物中侵染休眠细菌的病毒鉴定方法及其应用。本发明涉及微生物学及生物信息学技术领域,解决现有技术无法有效区分死菌DNA干扰、难以精准识别环境样本中休眠宿主以及病毒‑宿主匹配假阳性率较高的问题。本发明对河流沉积物样本进行叠氮...
  • 本发明涉及医学检测技术领域,具体涉及一种基于游离DNA寡核苷酸特征的孕早期子痫前期风险预警与分型方法。所述方法包括:获取孕早期孕妇血浆样本的低覆盖度全基因组测序数据;提取血浆游离DNA片段的末端基序序列;将末端基序序列转化为数值化特征向量;...
  • 本申请公开一种标记冗余基因数据的方法、系统及计算机可读存储介质。该方法包括:将待标记的基因数据文件分成多个数据块,其中,待标记的基因数据文件经过基于测序读段起始坐标的排序处理。将冗余基因标记流程设置为多级并行流水线,冗余基因标记流程的每个执...
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